キリスト教が迫害されていた19世紀初頭の朝鮮時代。熱心な教徒だった天才学者・丁若銓（チョン・ヤクチョン）は最果ての島に流刑になる。しかしそこでは、豊かな海と自然、そして素朴な人々との出会いがある。次第に海の生物たちの魅力にとりつかれ、庶民のための”海洋学書”を書き記したい欲望が生まれていく。そして島民の誰より海の生物に詳しい若き漁夫・昌大（チャンデ）と出会い、やがて二人は互いに師となり友となる。